Category: медицина

Category was added automatically. Read all entries about "медицина".

а теперь поговорим

Рашкин с Шукшиной стоили России более 70 000 жизней

Показатель Израиля по летальности 6 на 1000. Россия 31, 4 умерших на 1000. В мировая летальность 2%. Этот лишний процент и есть процент глупости Рашкина-Шукшиной. Другими словами каждый третий умерший на совести антиваксеров. Рашкин с Шукшиной стоили России более 70 000 жизней. Реутов, однако.
Итак, разница между страной провакцинированной и Россией по летальности в 5 (пять) раз.
5 раз это коэффициент тупости антисемитизма.
а теперь поговорим

Беларусь реально вымирает

Катастрофа (12.10.2021)
https://t.me/suzdaltsev/1463
Мозаика новостей о ситуации с  прохождением  четвертой волны COVID-19 в Беларуси обескураживает. Белорусское руководство продолжает упорно придерживаться политики 2020 года, что включает дежурный оптимизм в государственных СМИ и попытки использовать очередную мнимую победу над эпидемией в целях легитимизации шестого срока А. Лукашенко.  Напомним, что в прошлом году А. Лукашенко дважды объявлял о победе над коронавирусом без вакцины. В 2021 году белорусский руководитель уже дважды заявлял о создании белорусской вакцины. Но до сегодняшнего дня в небольшой республике, куда поставлялась российская и китайская вакцина вакцинация не закончена. Сейчас выяснилось, что в медучреждениях не хватает кислорода, врачей, мест для больных катастрофически не хватает, люди умирают в скорых.
Но самое главное, что оценить уровень катастрофы не позволяет крайне лживая статистика. Напомним, что в прошлом году в довакцинный  период статистика демонстрировала уровень заболеваемости и смертности от COVID-19 в РБ на порядок меньше, чем в соседних странах – Польше, Литве и России. При этом никакого внятного объяснения такого феномена без вакцин от белорусских властей так и не поступило. Рассуждения А. Лукашенко о санаторном лечении, как панацеи от коронавируса, не выдерживает никакой критики в ситуации, когда сплошь и рядом заболевших людей оставляют дома, так как в больницах нет мест. О каком санаторной реабилитации можно в этих условиях вести речь?
Во всем этом есть и политический контекст. Только на прошлой неделе ношение масок в Беларуси в общественных местах стало обязательным – после 18 месяцев эпидемии (!). До недавнего времени ярые сторонники А. Лукашенко (https://kyky-public-storage.s3.eu-central-1.amazonaws.com/ckeditor/pictures/18330/content_photo_2020-05-09_11-14-42.jpg), увлеченные перспективой лечения коронавируса трактором, баней и водкой, демонстративно игнорировали элементарные санитарные требования. В итоге данная политизированная часть белорусского населения, активно принимавшей участие в различного рода массовых мероприятиях в пользу А. Лукашенко, оказалась самой пострадавшей.
Беларусь реально вымирает. На поликлиники и больницы страшно смотреть, как и на кладбища с крематориями. А. Лукашенко остается для Беларуси знаком смерти.
а теперь поговорим

Вирус COVID-19 существует, и он опасен

Валерий Вечорко
https://t.me/vivechorko/206
За две недели в Москве в полтора раза выросла заболеваемость коронавирусом, и вдвое число госпитализаций. Снова перепрофилируются стационары на прием больных с коронавирусной инфекцией. В городе открыли 20 точек для экспресс-тестирования на COVID-19. Хочу напомнить, что в последнее время стали болеть молодые, и довольно тяжело, вплоть до летальных случаев. Высокий уровень смертности можно объяснить мутацией вируса, низким уровнем вакцинации и несерьезным отношением граждан к пандемии. Вирус COVID-19 существует, и он опасен. Помните об этом. Вакцинируйтесь, проходите тестирование и соблюдайте меры безопасности. https://ria.ru/20211011/covid-19-1753959058.html?utm_source=yxnews&utm_medium=desktop
а теперь поговорим

Коронавирус не может бесконечно увеличивать свою приспособленность

Коронавирус не может бесконечно увеличивать свою приспособленность

Авторы опубликованной на bioRxiv статьи, среди которых Фэн Чжан, Юрий Вольф и Евгений Кунин, рассмотрели перспективы появления новых мутаций в гене S-белка коронавируса SARS-CoV-2, которые бы позволяли ему ускользать от иммунного ответа. Моделирование показало, что у варианта дельта таких возможностей меньше, чем у гаммы и вируса дикого типа. Со всеми необходимыми оговорками исследователи отмечают, что это — «хорошая новость».

Возможность появления новых мутаций авторы статьи исследовали in silico, с помощью компьютерного моделирования. При этом в центре внимания было эпистатическое взаимодействие новых мутаций коронавируса. В учебниках по классической генетике говорится, что эпистаз — это воздействие одного гена на фенотипические проявления другого, неаллельного ему. Методы современной биологии позволяют рассматривать эпистатические взаимодействия между мутациями в двух участках одного гена, которым соответствуют разные фрагменты одного белка. Если две такие мутации повышают общую приспособленность организма, это называется положительным эпистазом, если снижают — отрицательным эпистазом.

Положительный эпистаз следует отличать от аддитивного взаимодействия, когда эффект двойной мутации равен сумме эффектов каждой из мутаций. Аддитивное взаимодействие возможно, если одна мутация никак не влияет на проявление другой. Но в пределах одного белка нетрудно представить ситуацию, когда одна мутация — например, уничтожающая цистеиновый мостик или нарушающая третичную структуру белка более тонким путем — влияет на остальные. Поэтому эпистатические взаимодействия играют важную роль в эволюции белков коронавирусов.

Понятие эпистаза имеет прямое отношение к коронавирусной пандемии. Весь мир следит за появлением новых вариантов и обсуждает, как изменяют свойства вируса новые мутации. Особое значение имеют мутации в рецепторсвязывающем домене (RBD) S-белка SARS-CoV-2. Этот домен отвечает за взаимодействие с клеточным рецептором ACE2 и проникновение вируса в клетку. Естественно, что антитела, которые связываются с RBD, часто являются нейтрализующими (NAb), то есть снижают инфекционность вируса. (Хотя есть нейтрализующие антитела, которые распознают и другие участки S-белка.)

Опасным может оказаться новый вариант вируса, RBD которого прочно связывается с клеточным рецептором (то есть вирус сохраняет способность поражать клетку) и при этом непрочно — с нейтрализующими антителами против старых вариантов коронавируса (вирус ускользает от иммунного ответа у переболевших или вакцинированных). Вопрос, насколько вероятно появление новых таких вариантов, волнует всех. А произойти это может за счет эпистаза — комбинации мутаций, которая изменит структуру RBD, придав ему два взаимоисключающих на данный момент свойства.

Авторы статьи, размещенной на bioRxiv, проверили, как повлияют мутации в RBD, приводящие к замене одной аминокислоты, на взаимодействие с ACE2 и NAb у коронавируса дикого типа (WT), а также у вариантов гамма (замены аминокислот в RBD — 417T, 484K, 501Y) и дельта (452R, 478K). Для моделирования использовали программный пакет Rosetta.

Новые по сравнению c WT мутации в сайтах, критичных для связывания, расположили в координатной плоскости, где по горизонтальной оси откладывается влияние мутации на аффинность связывания с рецептором, а по вертикальной — на аффинность связывания с нейтрализующим антителом. Наиболее опасными должны быть мутации, которые ослабляют связывание с антителом, не ослабляя связывание с рецептором (темно-розовый квадрант). Все мутации, ухудшающие связывание с рецептором, снижают жизнеспособность вируса и менее страшны для нас.

Ожидаемо, большая часть исследованных мутаций расположилась по диагонали квадрата: ухудшение связывания нейтрализующих антител ухудшает и связывание с рецептором. Потенциально опасны мутации, которые оказались над диагональю в левой части плоскости (точки, обведенные черным). Они получат преимущества в популяции, где большинство людей имеет иммунитет.

Согласно результатам моделирования, некоторые мутации в шести сайтах (417, 477, 484, 491, 493, 499) дестабилизируют комплекс RBD-NAb сильнее, чем комплекс RBD-ACE2. Мутации в сайте 453 одновременно стабилизируют комплекс RBD-ACE2 и дестабилизируют комплекс RBD-NAb.

Эти сайты эпидемиологам знакомы. По данным GISAID, замены 501Y (вариант альфа), 477N, 439K, 484K, 478K и 459F появились с июля по ноябрь 2020 года. Одиночные мутанты в итоге были вытеснены четырьмя вариантами с множественными мутациями в RBD (452R|478K/дельта, 417T|484K|501Y/гамма, 417N|484K|501Y/бета, 346K|484K|501Y). В марте 2021 года варианты альфа, гамма и дельта стали более распространенными, чем WT.

Почему варианты с одиночными мутациями вытесняются множественными — например, на смену альфе с мутацией 501Y приходят бета и гамма, которые содержат эту мутацию, но не только ее? Причиной могут быть как аддитивные взаимодействия, так и эпистатические. Например, мутация 501Y увеличивает аффинность связывания с рецептором ACE2, и она давала вирусу преимущество в популяции, где людей с иммунитетом мало. У варианта бета 417N сильно мешает связыванию антител, а 501Y выполняет компенсаторную роль, не позволяя вирусу «потерять» рецептор. Это пример положительного эпистаза.

Самый актуальный вопрос: какие мутации могут повысить приспособленность широко распространенных новых вариантов, таких как гамма и дельта?

Аналогичное моделирование для гаммы и дельты дало обнадеживающий результат. Новых мутаций, способных к эпистатическому взаимодействию к нарушению взаимодействия с антителами, но не с рецепторами, для этих вариантов не так много. Кандидантных мутаций, которые улучшили бы приспособленность дикого типа, но не дельты, больше, чем таких, которые улучшили бы приспособленность дельты, но не дикого типа. Иными словами, у дельты меньше шансов эволюционировать в более опасную сторону.

У варианта гамма конформация RBD в комплексе с АСЕ2 иная, чем у дельты и дикого типа, и во взаимодействие с АСЕ2 вовлечено больше аминокислот, следовательно, и чувствительность к мутациям у него должна быть ниже. (Интересно, что замена 484K у гаммы не влияет на взаимодействие с АСЕ2, но влияет на взаимодействие с антителами.) Для варианта гамма кандидатных мутаций найдено на 22% больше, чем у дикого типа. Тем не менее появление подобной мутации менее вероятно, чем такой, которая снизит эффективность связывания с рецептором.

В итоге выделены мутации, значительно увеличивающие риск ускользания от иммунного ответа, — те, что приводят к заменам в трех сайтах RBD: 417, 477, 494, а также близких к ним. Сайт 417 актуален только для гаммы, она уже содержит замену 417T, но другие изменения в этом сайте могут усилить ускользание. Замены в сайте 494 способны значительно усилить уход от иммунного ответа, если возникнут в гамме, но гораздо меньше — в дельте. Действительно, есть экспериментальные данные, согласно которым замена 494P снижала нейтрализующую активность сыворотки переболевших.

Таким образом, потенциал для появления вариантов, обеспечивающих уклонение от иммунной системы, у коронавируса ограничен. «Мы пришли к выводу, что небольшой набор мутаций, усиливающих ускользание, уже идентифицированных для дикого типа, вероятно, включает большинство всех возможных мутаций с этим эффектом», — отмечают авторы. «По мере роста количества вакцинированных в мире можно ожидать появления новых мутаций, дестабилизирующих взаимодействия RBD как с NAb, так и с ACE2, что приведет к появлению (частично) ускользающим вариантам, которые, однако, также будут иметь пониженную инфекционность. Однако варианты, подобные гамме, которые несут как мутацию, дестабилизирующую комплекс с антителом, так и компенсаторную мутацию, могут подорвать эту тенденцию».

Методы структурного моделирования, использованные в этой работе, можно использовать для оценки эволюционного потенциала новых вариантов, вызывающих опасения. Они позволят выделить варианты, требующие более пристального наблюдения и, возможно, разработки индивидуализированной вакцины.

Nash D. Rochman, Guilhem Faure, Yuri I. Wolf, Peter L. Freddolino, Feng Zhang, Eugene V. Koonin. Epistasis at the SARS-CoV-2 RBD Interface and the Propitiously Boring Implications for Vaccine Escape // bioRxiv. 2021. DOI:  10.1101/2021.08.30.458225

Спасибо https://pcr.news/novosti/koronavirus-ne-mozhet-beskonechno-uvelichivat-svoyu-prisposoblennost/

а теперь поговорим

Коронановости от Шарова

Вакцинация против COVID-19 индуцирует антитела против десяти коронавирусов у людей, перенесших SARS
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22072

Вакцинация «Спутником V» снижает риск тяжелого течения COVID-19 в пять раз, показало исследование в Санкт-Петербурге
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22073

Вакцинированные избавляются от вируса в носоглотке гораздо быстрее по сравнению с невакцинированными
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22074

Можно ли всё-таки делать прививку во время эпидемии? Откуда взялось это утверждение и насколько оно правдиво? Проводили ли когда-нибудь раньше вакцинацию во время вспышки заболевания?
https://www.youtube.com/watch?v=xQgomNrp5a0

Разработчики вакцины «Ковивак» опубликовали результаты доклинических исследований
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22087

НОВОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ ВАКЦИНЫ «СПУТНИК V» В АРГЕНТИНЕ: «НАБЛЮДЕНИЯ ДАЮТ ОСНОВАНИЯ ПОЛАГАТЬ, ЧТО ЗАЩИТА ОРГАНИЗМА ПРОТИВ НОВЫХ ШТАММОВ КОРОНАВИРУСА, СОДЕРЖАЩИХ МУТАЦИИ, ПОЗВОЛЯЮЩИЕ ИЗБЕГАТЬ ЗАЩИТНОГО ИММУНИТЕТА, УВЕЛИЧИВАЕТСЯ В ТЕЧЕНИЕ 6 МЕСЯЦЕВ ПОСЛЕ ВАКЦИНАЦИИ
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22088

Бустерная доза вакцины J&J увеличивает уровень антител к коронавирусу
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22089

Мои мысли о естественном иммунитете и иммунитете после вакцинации (о данных израильской статьи)
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22094

О новой политике в отношении мониторинга вируса в Великобритании
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22095

Исследование: переболевшие COVID-19 лучше защищены от штамма «Дельта»
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22096

В Китае изучили долгосрочные последствия COVID-19
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22097

Валерий Вечорко Щитовидная железа и Covid-19.
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22098

Моноклональные антитела от Regeneron помогают пациентам с COVID-19 из группы высокого риска
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22099

Потенциальное лекарство от COVID-19 ингибирует новые штаммы
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22101

РФПИ: взаимопризнание российских и зарубежных вакцин от COVID-19 может произойти до конца 2021 года
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15797-вакцинные-войны-и-дипломатия-вакцин/?p=22111

Получены оценки эффективности ревакцинации в Израиле
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22114

Первая в мире ДНК-вакцина против COVID-19 одобрена в Индии
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22115

Бесплодные попытки напугать бесплодием
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22125

Тканевые маски не теряют защитных свойств даже через год активного ношения
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22127

Продолжаем смотреть на вакцинацию как на медицинское решение с присущим ему обменом рисками. В приложении к вакцинации беременных необходимо сравнить ковидные риски неблагоприятных материнских, пери- и неонатальных исходов с таковыми у привитых в течение беременности.
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22131


Для будущих мам заболевание COVID-19 большой стресс.
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22132

Почему вакцины от ковида были разработаны так быстро?
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22133

FDA предупреждает о ложноположительных результатах двух тестов Abbott на SARS-CoV-2
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15327-лабораторная-диагностика-коронавирусной-инфе/?p=22134

Одобрены клинические исследования российской субъединичной вакцины против коронавируса
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22143

Найдены новые коронавирусы летучих мышей, сходные с SARS-CoV-2
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15894-хроника-грядущих-пандемий/?p=22144

Вакцины от COVID-19: клинические исследования
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22149

"До прививки от оспы – широко применялась вариоляция"
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22156

Спутник, КовиВак и ЭпиВакКорона: новости об эффективности
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22157

Канадское исследование продемонстрировало высокую вирулентность штамма дельта
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/15322-covid-19-sars-cov2/?p=22161
а теперь поговорим

Продемонстрировало высокую вирулентность штамма дельта

Канадское исследование продемонстрировало высокую вирулентность штамма дельта

Вирулентность вариантов, вызывающих опасения, изучили на 212 326 больных COVID-19 в Канаде. У людей, зараженных штаммами альфа, бета и гамма, риск госпитализации был на 52% выше, попадания в отделение реанимации и интенсивной терапии — на 89% выше, смерти — на 51% выше, чем у зараженных штаммами первой волны. У людей с штаммом дельта эти риски были выше на 108%, 235% и 133%.

Канадские ученые проанализировали вирулентность вариантов, вызывающих опасение (VOC), в Онтарио. Исследуемая когорта состояла из 212 326 человек, у которых диагностировали COVID-19 в период с 7 февраля по 27 июня 2021 года. Рассматривали такие VOC, как альфа, бета и гамма (варианты, содержащие мутацию N501Y в S-белке), а также дельта. Из всех участников 22,4% были заражены штаммами первой волны, 76,7% — N501Y-положительными VOC, 2,8% — предположительно, штаммом дельта.

Люди, у которых определили VOC, были моложе и реже имели сопутствующие заболевания. N501Y-положительные VOC чаще встречались в метрополитенском ареале Торонто, штамм дельта реже встречался в Оттаве.

У людей, зараженных штаммами альфа, бета и гамма, риск госпитализации был на 52% выше, риск попадания в отделение реанимации и интенсивной терапии — на 89% выше, риск смерти — на 51% выше, чем у зараженных штаммами первой волны. У людей, зараженных штаммом дельта, эти риски были выше на 108%, 235% и 133%. Риски, ассоциированные с штаммом дельта, были значительно выше, чем ассоциированные с N501Y-положительными VOC. Анализ учитывал половые и возрастные различия, а также наличие или отсутствие вакцинации и сопутствующих заболеваний и временные тренды.

Таким образом, авторы продемонстрировали повышенную вирулентность штамма дельта по сравнению с штаммами первой волны и VOC. Результаты были значимыми, несмотря на малую долю случаев, связанных с дельтой.

Появление VOC затрудняет борьбу с пандемией: они обладают повышенной трансмиссивностью, вакцины становятся менее эффективными, а вирулентность коронавирусной инфекции повышается. Тем не менее, даже если вакцины не предотвращают заражение, риски тяжелого протекания заболевания и смерти сильно снижаются.

У исследования имеется важное ограничение. В начале изучаемого периода (до мая 2021 года) штамм дельта мог был неверно классифицирован как штамм первой волны из-за отсутствия рутинных методов скрининга. Таким образом, вирулентность штамма дельта может быть еще выше.

Fisman D.N., et al. Evaluation of the relative virulence of novel SARS-CoV-2 variants: a retrospective cohort study in Ontario, Canada // Canadian Medical Association Journal (2021), published October 04, 2021, DOI: 10.1503/cmaj.211248

https://pcr.news/novosti/kanadskoe-issledovanie-prodemonstrirovalo-vysokuyu-virulentnost-shtamma-delta/

а теперь поговорим

До прививки от оспы – широко применялась вариоляция

Моё замечание к тексту

О вакцинах и антиваксерах – движение по кругу



"До прививки от оспы – широко применялась вариоляция".
По сути вариоляция тоже прививка.
Поэтому вернее
До вакцинации от оспы широко применялась вариоляция.

Вакцинация — это использование гетерогенной системы оспы коровы (современный аналог живая ослабленная вакцина), вариоляция использование нежизнеспособного вируса (аналог цельновирусная вакцина на основе убитого вируса, а ля "Ковивак"). Другое дело, иногда (2%) при вариоляции вирус был вполне жизнеспособным и его хватало для смертельного заражения.

Как и откуда при вакцинации вирус коровьей оспы заменился на вирус осповакцины никто не знает.