July 11th, 2014

экспертное

Первый крупнейший междисциплинарный научный форум - Moscow Science Week 2014!

Оригинал взят у hullam_del_ray в ВНИМАНИЕ!
С 8 по 12 сентября 2014 года в столице состоится первый крупнейший междисциплинарный научный форум - Moscow Science Week 2014!

Moscow Science Week на одной площадке объединяет лекции выдающихся ученых, которые познакомят молодых исследователей со своим авторитетным взглядом на проблемы современной науки, выступления лауреатов молодежных научных премий, постерные сессии и выставки инновационных продуктов и технологий, панельные дискуссии и круглые столы, где в горячем споре сталкиваются разные точки зрения и рождаются идеи междисциплинарного взаимодействия, мастер-классы, призванные помочь молодым исследователям развить свои профессиональные навыки.

Приглашаем начинающих и действующих "наукокрадов" принять участие в недельном научном форуме.

Подробную информацию Вы можете получить на сайте http://moscowscienceweek.ru/ , а так же посетив сообщества:
http://vk.com/moscowscienceweek
https://www.facebook.com/moscowscienceweek

Будем благодарны за репост данной новости. Мы стремимся развивать научную инфраструктуру России и хотим, чтобы как можно больше людей знали о данном мероприятии.



http://moscowscienceweek.ru/index.php/ru/

экспертное

Как раковые клетки теряют адгезию


картинка: Wind..pngПрикрепление клеток к физическому окружению, обязательное для их существования, в норме утрачивается при формировании зрелых клеток в гематопоэзе. Показано, что приобретение эпителиальными раковыми клетками способности к автономному существованию , облегчающее миграцию клеток в места формирования метастаз, связано с аномальной экспрессией характерного для гемтопоэтических клеток белка Aiolos. Aiolos подавляет экспрессию ряда генов, связанных с адгезией клеток, в том числе блокирует синтез мРНК р66Shc, ингибирующего сигнальные пути факторов роста и индуцирующего аноикоз.

Эпигенетические механизмы, участвующие в обретении опухолевыми клетками способности к метастазированию, еще мало изучены. В частности, не ясно, как перепрограммирование транскрипции придает эпителиальным клеткам свойства гематопоэтических, обеспечивая им способность к метастазированию. Aiolos (Эол – греческий бог ветра), кодируемый геном IKZF3 – членом семейства генов Ikaros, контролирующих белки с «цинковыми пальцами», в норме экспрессируется в лимфоидных клетках. Aiolos вызывает сильные изменения экспрессии ряда генов в основном вследствие мобилизации модификаторов хроматина, перестраивающих нуклеосомы и комплекса деацетилаз NuRD. В ряде работ было показано, что Aiolos экспрессируется в некоторых опухолях, но последствия этой экспрессии оставались полностью неизвестными.

Авторы предположили, что Aiolos может придавать раковым клеткам способность существовать без прикрепления к физическому окружению. Они изучили молекулярные и клинические последствия экспрессии Aiolos при раке легких. Было поведено иммуногистохимическое исследование экспрессии Aiolos в 116 опухолях немелкоклеточного рака (NSCLC), 17 мелкоклеточного рака (SCLC) и 7 образцив нормальных тканей легких вблизи опухолей. В нормальной ткани и в строме опухолей Aiolos не обнаруживался. В большинстве NSCLC и во всех SCLC клетках он присутствовал в ядре. В SCLC его было намного больше, чем в NSCLC, и для SCLC был характерен четко выраженный негативный прогноз, связанный с ранней диссеменацией и метастазированием.

Сравнение профилей экспрессируемых генов в культурах клеток карциномы легких А549 без эндогенного Aiolos и А549, в которые введен активно работающий ген IKZF3, выявило 270 генов, экспрессия которых подавлялась более чем в 2 раза и 267 генов, которые активировались более чем в 2 раза. Среди подавляемых оказался ряд генов, играющих важную роль в адгезии клетка-клетка или клетка-матрикс, среди активируемых – гены, связанные с метастазированием. Подавление экспрессии IKZF3 с помощью shРНК в активно синтезирующих Aiolos клетках Н1155 из опухоли NSCLC давало реципрокный эффект. Экспрессия Aiolos изменяла морфологию клеток, подавляла синтез белков важных для межклеточной адгезии, снижала их адгезию на фибронектин – основной компонент экстраклеточного матрикса легких и стромы опухоли. Aiolos придавал клеткам А549 способность расти в полужидком агаре, резко повышал эффективность образования метастаз в легких мышей при введении их в кровоток мышей. Проверка ряда линий клеток, полученных из раковых опухолей молочной железы, печени, толстого кишечника показала, что примерно в половине из них экспрессируется Aiolos, и его экспрессия коррелировала со способностью образовывать метастазы у мышей. Высокий уровень экспрессии Aiolos/IKZF3 при раке молочной железы у женщин коррелировал с негативным прогнозом развития заболевания.

Экспрессия Aiolos более чем в 2 раза подавляла синтез адаптерного белка Shc. Кодрующий его ген SHC1 имеет два промотора, независимо контролирующих синтез р52Shc и р66Shc. р66Shc требуется для осуществления аноикоза – программируемой гибели клеток при утрате контакта с физическим окружением. Эксперименты показали, что Aiolos подавляет экспрессию р66Shc, но не р52Shc, который для аноикоза не требуется. р66Shc, но не р52Shc является сильным супрессором метастазирования при введении клеток мышам. Но подавление Aiolos не восстанавливает экспрессию р66Shc. Aiolos может быть необходим для инициации, но не для поддержания супрессии р66Shc. Анализ клеточных линий из опухолей рака легких и клеток, полученных из опухолей показал, что Aiolos сильно подавляет р66Shc и in vitro, и in vivo.

Исследование взаимодействия Aiolos с нуклеотидными последовательностями, окружающими ген SHC1 показало, что Aiolos связывается с Е2 — одним из трех энхансеров, необходимых для эффективного синтеза мРНК р66Shc, и тремя окружающими Е2 участками. В результате разрушается транскрипционный комплекс р66Shc и блокируется его экспрессия.


Источник:
Li X, Xu Z, Du W, Zhang Z, Wei Y, Wang H, Zhu Z, Qin L, Wang L, Niu Q, Zhao X, Girard L, Gong Y, Ma Z, Sun B, Yao Z, Minna JD, Terada LS, Liu Z. Aiolos Promotes Anchorage Independence by Silencing p66Shc Transcription in Cancer Cells. // Cancer Cell. 2014; V. 25: P. 575-589.

с доски объявлений молбиола
экспертное

О Notch и раке молочной железы


картинка: TAM.pngРост раковой опухоли молочной железы сопровождается накоплением ассоциированных с опухолью макрофагов (TAMs), отличных от нормальных макрофагов ткани (MTMs) по функциональным и молекулярным характеристикам. В отличие от MTMs для формирования TAMs необходимо функционирование сигнального пути Notch. Подавление Notch и, соответственно, TAMs восстанавливает противоопухолевый иммунный ответ, осуществляемый Т-лимфоцитами и приводит к подавлению роста опухоли.

Недавно было показано, что кроме таких хорошо известных функций макрофагов для поддержания гомеостаза клеток и защиты организма от патогенов, они могут подавлять иммуносупрессию опухолей и способствовать их прогрессии. Высокая плотность макрофагов в опухоли связана с негативным прогнозом при ряде раков.

Авторы детально исследовали вклад макрофагов в развитие опухоли молочной железы у мышей. Они идентифицировали в опухолях особую разновидность макрофагов, названных TAMs (tumor-associated macrophages), экспрессирующих маркеры дендритных клеток MHCII и CD11c и маркер макрофагов F4/80. По морфологии, набору белковых маркеров они отличались от нормальных макрофагов ткани молочной железы MTMs (mammary tissue macrophages). При росте опухоли увеличивалось количество TAMs и уменьшалось количество MTMs.

С целью глубже изучить различия TAMs и MTMs в них был проанализирован профиль экспрессирующихся генов. В TAMs слабее чем в MTMs экспрессировался интегрин CD11b, но некоторые другие интегрины и рецептор Vcam1 экспрессировались намного активнее. Вопреки ранее высказанным предположениям о том, что с прогрессией опухоли могут быть ассоциированы так называемые альтернативно активированные макрофаги (ААМ), в TAMs не обнаруживался ряд маркеров, свойственных ААМ. Напротив, MTMs имели больше сходства с ААМ. Данные по экспрессии были подтверждены анализом белков. Было также показано, что усиленная экспрессия Vcam1 происходит на поздних стадиях дифференцировки TAMs. В общем оказалось, что TAMs не являются ААМ, и что их дифференцировка не является вторичным иммунным ответом, связанным с развитием опухоли. Профиль экспрессии генов TAMs выявил активную транскрипцию компонентов сигнального пути Notch. Эксперименты на опухолях мышей, у которых был выключен ключевой регулятор транскрипции Notch RBPJ, показали, что в таких условиях полной дифференцировки воспалительных моноцитов в TAMs не происходило. В то же время дифференцировка MTMs при этом не нарушалась.

Подавление сигнального пути Notch сопровождалось резким подавлением роста опухолей и усилением активности Т лимфоцитов. Таким образом, происходящие от моноцитов зависимые от Notch TAMs требуются для роста опухоли. Они подавляют иммунный ответ на опухоль, который осуществляют лимфоциты. Полученные результаты существенно дополняют сведения о роли макрофагов в биологии опухолей и, вероятно, открывают возможности для разработки способов лечения рака путем воздействия на TAMs-специфические механизмы.


Источники:
Franklin RA, Liao W, Sarkar A, Kim MV, Bivona MR, Liu K, Pamer EG, Li MO. The cellular and molecular origin of tumor-associated macrophages. // Science. 2014; V. 344: P. 921-925.

Perdiguero EG, Geissmann F. Cancer immunology. Identifying the infiltrators. // Science. 2014; V. 344: P. 801-802.

Подпись к рисунку: Три стадии прогрессии раковой опухоли. В центре показано происхождение ассоциированных с опухолью макрофагов, их способность блокировать работу Т-клеток.

Нашел на молбиоле
экспертное

И гидра болеет раком


картинка: Hydra_tumors.pngОпухоли (в том числе злокачественные), их возникновение и прогрессия по понятным причинам изучаются в основном на млекопитающих. Немногие работы посвящены изучению опухолей у беспозвоночных, в первую очередь у Drosophila и C. elegans, относящихся к кладе билатерально-симметричных животных. Между тем, гены, участвующие в онкогенезе у млекопитающих, появились в эволюции вместе с появлением многоклеточных животных. Исходя из этого, можно было бы ожидать, что опухоли могут возникать у всех многоклеточных животных, включая самых примитивных – типа губок и книдарий. Однако до недавнего времени этот вопрос практически не был изучен.

В только что вышедшей статье в Nature communications сообщается об открытии и изучении опухолей у двух видов гидр, представителей книдарий (Hydra oligactis и Pelmatohydra robusta). Авторы обратили внимание на странные новообразования эктодермы, спонтанно возникающие у гидр, живущих в лабораторной культуре. При почковании больных особей опухоли возникали у большинства дочерних особей. При трансплантации в здоровых гидр опухоли успешно развивались у реципиентов. Таким образом, авторы поддерживали несущие опухоли гидры в культуре на протяжении 5 лет. Опухоли не приводили к гибели животных, но значительно снижали как скорость почкования, так и способность к половому размножению. Анализ морфологии клеток и некоторых молекулярных маркеров показал, что опухоли представляют собой клетки половой линии, "застрявшие" на промежуточной фазе дифференцировки в женские половые клетки. (У гидры половые клетки развиваются из интерстициальных, давая начало яйцеклетке и многочисленным питающим клеткам; последние претерпевают массированный апоптоз и фагоцитируются развивающейся яйцеклеткой). Было установлено, что скорость пролиферации в опухолях примерно такая же, как и у нормальных клеток, однако апоптоз у них оказался подавленным. Таким образом, изученные опухоли возникают в результате блокирования дифференцировки ооцитов. При трансплантации меченые опухолевые клетки расползаются по организму реципиента гораздо быстрее, чем контрольные (нормальные), что напоминает поведение инвазивных опухолей млекопитающих. Анализ транскриптомов показал, что профили экспрессии генов сильно различаются у здоровых асексуальных животных, женских особей в процессе оогенеза и у опухолей. Было идентифицировано 196 опухолеспецифичных транскриптов, для 44 из которых существуют гомологи среди онкогенов млекопитающих. Кроме них, были найдены таксономически ограниченные гены, а также гены эволюционно консервативные, но не участвующие в онкогенезе у позвоночных. Авторы проанализировали паттерн экспрессии гена, гомологичного tpt1 (translationally controlled tumor protein1, p23) – он активно транскрибируется в опухолях, но не в здоровых животных (см.рис.).

Таким образом, полученные результаты представляют собой впервые изученный процесс опухолеобразования у эволюционно древних животных, возникших до появления билатерий. Это открытие сильно меняет представление об эволюционных корнях онкогенеза – спонтанное опухолеобразование, видимо, представляет собой древнейший процесс, а не является "изобретением" эволюционно продвинутых животных. Помимо этого, есть еще один интересный аспект. Известно, что гидры являются редким примером потенциально бессмертных животных, однако даже они не оказались способны избежать появления опухолей.

Картинки из рассматриваемой статьи:
Верхний ряд: эволюционное древо животных с предсказанным моментом появления опухолей.
Нижний ряд: экспрессия гена tpt1/p23 в гидрах с опухолями (слева), в здоровых асексуальных (в середине) и женских особях (справа) (на врезках – негативный контроль).

Источник:
Domazet-Loso T et al. Naturally occurring tumours in the basal metazoan Hydra Nat Commun. 2014 Jun 24;5:4222.

Из новостей молбиол
экспертное

ERA.Net RUS plus РФФИ

Оригинал взят у fp7_bio_ru в ERA.Net RUS plus РФФИ

Конкурс 2016 года инициативных научных проектов, проводимый РФФИ совместно с организациями-участниками программы «ERA.Net RUS plus»

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Российский фонд фундаментальных исследований» (далее – Фонд) и организации-участники программы «ERA.Net RUS plus», все вместе – Организаторы конкурса, действуя на основании «Соглашения о реализации конкурса научно-технических проектов программы «ERA.Net RUS plus»» от «20» июня 2014 г., далее - Соглашение, объявляют о проведении конкурса инициативных научных проектов 2016 года (далее – Конкурс) по темам:

1. Научно-технологические проекты в нанотехнологиях (S&T projects in Nanotechnology):
- Продвинутые нано-сенсоры для окружающей среды и здравоохранения (Advanced nano-sensors for environment and health);
- Новые функциональные наноматериалы на основе проектирования и моделирования (Novel functional nanomaterials based on design and modelling);
- Наноматериалы для эффективного освещения (Nanomaterials for efficient lighting).

2. Научно-технологические проекты в области окружающей среды и изменения климата (S&T projects in Environment/Climate change):
- Повышение достоверности региональных климатических прогнозов: модели и измерения (Increasing the reliability of regional climate projections: models and measurement);
- Воздействие на окружающую среду и риск от добычи и транспортировки полезных ископаемых (Environmental impact and risk of raw materials extraction and transportation);
- Экстремальные климатические явления и их влияние на окружающую среду (Extreme climate events and their impact on the environment).

3. Научно-технологические проекты в области наук о здоровье (S&T projects in Health):
- Молекулярные механизмы функционирования мозга и патологии (Molecular mechanisms of brain function and pathology);
- Регенеративная медицина и биоматериалы (Regenerative medicine and biomaterials);
- Разработка препаратов для лечения рака, сердечно-сосудистых и инфекционных заболеваний (Drug discovery for cancer, cardiovascular and infectious diseases).

Код Конкурса - «ЭРА_а»

Текст Объявления о Конкурсе опубликован на сайте Секретариата конкурса.